Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGDSO95455 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGDSO95455 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGDSO95455 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGDSO95455 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGDSO95455 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGDSO95455 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGDSO95455 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGDSO95455 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TGDSO95455 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGDSO95455 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGDSO95455 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGDSO95455 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGDSO95455 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TGDSO95455 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGDSO95455 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGDSO95455 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGDSO95455 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGDSO95455 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGDSO95455 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGDSO95455 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGDSO95455 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGDSO95455 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TGDSO95455 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TGDSO95455 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGDSO95455 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGDSO95455 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGDSO95455 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGDSO95455 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGDSO95455 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGDSO95455 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGDSO95455 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGDSO95455 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TGDSO95455 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TGDSO95455 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TGDSO95455 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGDSO95455 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGDSO95455 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGDSO95455 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TGDSO95455 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGDSO95455 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TGDSO95455 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGDSO95455 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGDSO95455 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TGDSO95455 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGDSO95455 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGDSO95455 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGDSO95455 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TGDSO95455 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TGDSO95455 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGDSO95455 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TGDSO95455 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TGDSO95455 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TGDSO95455 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGDSO95455 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TGDSO95455 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGDSO95455 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGDSO95455 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGDSO95455 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TGDSO95455 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TGDSO95455 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TGDSO95455 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGDSO95455 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TGDSO95455 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TGDSO95455 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGDSO95455 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TGDSO95455 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGDSO95455 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TGDSO95455 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TGDSO95455 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGDSO95455 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGDSO95455 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TGDSO95455 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TGDSO95455 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TGDSO95455 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TGDSO95455 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TGDSO95455 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TGDSO95455 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TGDSO95455 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TGDSO95455 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TGDSO95455 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TGDSO95455 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGDSO95455 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TGDSO95455 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGDSO95455 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGDSO95455 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TGDSO95455 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TGDSO95455 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TGDSO95455 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGDSO95455 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGDSO95455 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGDSO95455 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGDSO95455 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TGDSO95455 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGDSO95455 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TGDSO95455 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGDSO95455 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TGDSO95455 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGDSO95455 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TGDSO95455 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms