Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNFAIP8O95379 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNFAIP8O95379 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNFAIP8O95379 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP8O95379 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFAIP8O95379 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFAIP8O95379 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFAIP8O95379 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms