Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNH1O95259 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNH1O95259 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KCNH1O95259 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNH1O95259 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNH1O95259 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNH1O95259 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNH1O95259 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH1O95259 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH1O95259 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH1O95259 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNH1O95259 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms