Protein–RNA interactions for Protein: O75838

CIB2, Calcium and integrin-binding family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB2O75838 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIB2O75838 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIB2O75838 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIB2O75838 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIB2O75838 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIB2O75838 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIB2O75838 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIB2O75838 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIB2O75838 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIB2O75838 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIB2O75838 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIB2O75838 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIB2O75838 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIB2O75838 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIB2O75838 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIB2O75838 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIB2O75838 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIB2O75838 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIB2O75838 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIB2O75838 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIB2O75838 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIB2O75838 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIB2O75838 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIB2O75838 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIB2O75838 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CIB2O75838 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIB2O75838 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIB2O75838 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIB2O75838 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIB2O75838 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIB2O75838 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CIB2O75838 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CIB2O75838 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CIB2O75838 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CIB2O75838 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIB2O75838 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIB2O75838 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIB2O75838 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CIB2O75838 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CIB2O75838 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CIB2O75838 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIB2O75838 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CIB2O75838 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIB2O75838 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIB2O75838 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIB2O75838 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CIB2O75838 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CIB2O75838 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CIB2O75838 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIB2O75838 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CIB2O75838 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CIB2O75838 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CIB2O75838 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CIB2O75838 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CIB2O75838 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CIB2O75838 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CIB2O75838 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CIB2O75838 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CIB2O75838 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CIB2O75838 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CIB2O75838 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CIB2O75838 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIB2O75838 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIB2O75838 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CIB2O75838 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIB2O75838 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIB2O75838 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CIB2O75838 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CIB2O75838 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CIB2O75838 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CIB2O75838 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CIB2O75838 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CIB2O75838 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CIB2O75838 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIB2O75838 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIB2O75838 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CIB2O75838 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CIB2O75838 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIB2O75838 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIB2O75838 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIB2O75838 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIB2O75838 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CIB2O75838 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CIB2O75838 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CIB2O75838 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIB2O75838 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIB2O75838 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIB2O75838 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CIB2O75838 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CIB2O75838 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIB2O75838 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIB2O75838 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CIB2O75838 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CIB2O75838 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIB2O75838 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIB2O75838 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CIB2O75838 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIB2O75838 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CIB2O75838 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CIB2O75838 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms