Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPRLO75663 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TIPRLO75663 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIPRLO75663 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIPRLO75663 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TIPRLO75663 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TIPRLO75663 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
TIPRLO75663 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TIPRLO75663 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TIPRLO75663 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TIPRLO75663 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TIPRLO75663 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIPRLO75663 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TIPRLO75663 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms