Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KATNA1O75449 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KATNA1O75449 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KATNA1O75449 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KATNA1O75449 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KATNA1O75449 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms