Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RAB11FIP3O75154 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RAB11FIP3O75154 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAB11FIP3O75154 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RAB11FIP3O75154 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAB11FIP3O75154 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RAB11FIP3O75154 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RAB11FIP3O75154 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RAB11FIP3O75154 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RAB11FIP3O75154 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RAB11FIP3O75154 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RAB11FIP3O75154 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RAB11FIP3O75154 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RAB11FIP3O75154 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAB11FIP3O75154 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RAB11FIP3O75154 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RAB11FIP3O75154 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RAB11FIP3O75154 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
RAB11FIP3O75154 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RAB11FIP3O75154 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
RAB11FIP3O75154 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms