Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SMARCA5O60264 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
SMARCA5O60264 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SMARCA5O60264 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SMARCA5O60264 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMARCA5O60264 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMARCA5O60264 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMARCA5O60264 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms