Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GATCO43716 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATCO43716 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATCO43716 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATCO43716 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GATCO43716 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GATCO43716 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GATCO43716 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
GATCO43716 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GATCO43716 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GATCO43716 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GATCO43716 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GATCO43716 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GATCO43716 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GATCO43716 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GATCO43716 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GATCO43716 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GATCO43716 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GATCO43716 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GATCO43716 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GATCO43716 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GATCO43716 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GATCO43716 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GATCO43716 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GATCO43716 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GATCO43716 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GATCO43716 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GATCO43716 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GATCO43716 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GATCO43716 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GATCO43716 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GATCO43716 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GATCO43716 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GATCO43716 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATCO43716 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATCO43716 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATCO43716 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATCO43716 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATCO43716 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GATCO43716 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATCO43716 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATCO43716 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATCO43716 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATCO43716 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATCO43716 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATCO43716 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATCO43716 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATCO43716 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATCO43716 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATCO43716 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATCO43716 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATCO43716 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATCO43716 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATCO43716 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATCO43716 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATCO43716 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATCO43716 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATCO43716 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATCO43716 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATCO43716 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GATCO43716 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATCO43716 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATCO43716 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATCO43716 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATCO43716 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GATCO43716 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATCO43716 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATCO43716 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GATCO43716 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GATCO43716 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATCO43716 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATCO43716 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GATCO43716 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATCO43716 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATCO43716 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GATCO43716 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATCO43716 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATCO43716 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATCO43716 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATCO43716 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATCO43716 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATCO43716 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GATCO43716 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATCO43716 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GATCO43716 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATCO43716 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATCO43716 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATCO43716 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GATCO43716 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATCO43716 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GATCO43716 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATCO43716 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATCO43716 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATCO43716 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATCO43716 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GATCO43716 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GATCO43716 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATCO43716 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GATCO43716 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GATCO43716 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms