Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SUV39H1O43463 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SUV39H1O43463 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SUV39H1O43463 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SUV39H1O43463 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SUV39H1O43463 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUV39H1O43463 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUV39H1O43463 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SUV39H1O43463 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms