Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTIFO43310 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTIFO43310 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTIFO43310 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTIFO43310 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTIFO43310 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTIFO43310 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTIFO43310 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTIFO43310 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTIFO43310 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTIFO43310 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTIFO43310 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTIFO43310 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTIFO43310 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTIFO43310 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTIFO43310 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTIFO43310 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTIFO43310 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTIFO43310 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTIFO43310 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTIFO43310 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTIFO43310 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTIFO43310 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTIFO43310 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTIFO43310 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTIFO43310 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTIFO43310 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTIFO43310 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTIFO43310 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTIFO43310 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTIFO43310 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTIFO43310 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTIFO43310 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
CTIFO43310 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTIFO43310 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTIFO43310 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTIFO43310 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTIFO43310 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTIFO43310 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTIFO43310 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTIFO43310 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTIFO43310 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTIFO43310 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTIFO43310 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTIFO43310 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTIFO43310 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTIFO43310 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTIFO43310 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTIFO43310 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTIFO43310 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTIFO43310 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTIFO43310 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTIFO43310 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTIFO43310 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTIFO43310 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTIFO43310 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTIFO43310 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTIFO43310 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTIFO43310 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTIFO43310 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CTIFO43310 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTIFO43310 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTIFO43310 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTIFO43310 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTIFO43310 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTIFO43310 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTIFO43310 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTIFO43310 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTIFO43310 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTIFO43310 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTIFO43310 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTIFO43310 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTIFO43310 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTIFO43310 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTIFO43310 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTIFO43310 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTIFO43310 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTIFO43310 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTIFO43310 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTIFO43310 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTIFO43310 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTIFO43310 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTIFO43310 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTIFO43310 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTIFO43310 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTIFO43310 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTIFO43310 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTIFO43310 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTIFO43310 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTIFO43310 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTIFO43310 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTIFO43310 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTIFO43310 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTIFO43310 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTIFO43310 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTIFO43310 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTIFO43310 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTIFO43310 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTIFO43310 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTIFO43310 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms