Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2AO14813 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2AO14813 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PHOX2AO14813 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PHOX2AO14813 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHOX2AO14813 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PHOX2AO14813 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PHOX2AO14813 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHOX2AO14813 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PHOX2AO14813 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms