Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRDMT1O14717 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRDMT1O14717 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRDMT1O14717 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDMT1O14717 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDMT1O14717 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRDMT1O14717 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRDMT1O14717 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRDMT1O14717 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRDMT1O14717 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRDMT1O14717 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRDMT1O14717 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRDMT1O14717 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRDMT1O14717 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRDMT1O14717 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRDMT1O14717 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms