Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCYO14598 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCYO14598 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCYO14598 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCYO14598 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VCYO14598 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCYO14598 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCYO14598 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCYO14598 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VCYO14598 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VCYO14598 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCYO14598 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCYO14598 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCYO14598 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCYO14598 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCYO14598 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VCYO14598 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCYO14598 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VCYO14598 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VCYO14598 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCYO14598 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VCYO14598 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCYO14598 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VCYO14598 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCYO14598 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VCYO14598 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VCYO14598 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VCYO14598 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VCYO14598 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VCYO14598 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VCYO14598 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VCYO14598 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VCYO14598 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VCYO14598 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VCYO14598 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VCYO14598 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VCYO14598 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VCYO14598 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VCYO14598 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VCYO14598 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCYO14598 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCYO14598 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCYO14598 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCYO14598 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCYO14598 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCYO14598 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VCYO14598 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCYO14598 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCYO14598 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCYO14598 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCYO14598 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCYO14598 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VCYO14598 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCYO14598 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCYO14598 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCYO14598 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCYO14598 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCYO14598 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VCYO14598 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCYO14598 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCYO14598 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VCYO14598 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VCYO14598 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VCYO14598 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VCYO14598 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VCYO14598 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VCYO14598 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VCYO14598 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VCYO14598 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VCYO14598 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VCYO14598 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VCYO14598 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VCYO14598 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VCYO14598 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VCYO14598 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VCYO14598 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VCYO14598 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VCYO14598 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VCYO14598 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VCYO14598 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VCYO14598 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VCYO14598 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VCYO14598 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VCYO14598 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VCYO14598 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VCYO14598 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VCYO14598 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VCYO14598 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VCYO14598 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VCYO14598 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VCYO14598 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VCYO14598 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VCYO14598 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms