Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAFD1O14545 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAFD1O14545 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAFD1O14545 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAFD1O14545 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAFD1O14545 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAFD1O14545 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAFD1O14545 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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