Protein–RNA interactions for Protein: H3BR10

SMLR1, Small leucine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMLR1H3BR10 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMLR1H3BR10 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMLR1H3BR10 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMLR1H3BR10 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMLR1H3BR10 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMLR1H3BR10 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMLR1H3BR10 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms