Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DIRC3C9JPN6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DIRC3C9JPN6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DIRC3C9JPN6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DIRC3C9JPN6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DIRC3C9JPN6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms