Protein–RNA interactions for Protein: A8MTL3

RNF212B, RING finger protein 212B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212BA8MTL3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF212BA8MTL3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF212BA8MTL3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF212BA8MTL3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF212BA8MTL3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF212BA8MTL3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF212BA8MTL3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF212BA8MTL3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF212BA8MTL3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF212BA8MTL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF212BA8MTL3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms