Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOBPA7XYQ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOBPA7XYQ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SOBPA7XYQ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOBPA7XYQ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOBPA7XYQ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOBPA7XYQ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOBPA7XYQ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SOBPA7XYQ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
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