Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SOBPA7XYQ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SOBPA7XYQ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SOBPA7XYQ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SOBPA7XYQ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
SOBPA7XYQ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SOBPA7XYQ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
SOBPA7XYQ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SOBPA7XYQ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SOBPA7XYQ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SOBPA7XYQ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SOBPA7XYQ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SOBPA7XYQ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SOBPA7XYQ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SOBPA7XYQ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SOBPA7XYQ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SOBPA7XYQ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SOBPA7XYQ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SOBPA7XYQ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SOBPA7XYQ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SOBPA7XYQ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SOBPA7XYQ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SOBPA7XYQ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
SOBPA7XYQ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SOBPA7XYQ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SOBPA7XYQ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SOBPA7XYQ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SOBPA7XYQ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SOBPA7XYQ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SOBPA7XYQ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SOBPA7XYQ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SOBPA7XYQ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SOBPA7XYQ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SOBPA7XYQ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOBPA7XYQ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SOBPA7XYQ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SOBPA7XYQ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SOBPA7XYQ1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SOBPA7XYQ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SOBPA7XYQ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SOBPA7XYQ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
SOBPA7XYQ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SOBPA7XYQ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SOBPA7XYQ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SOBPA7XYQ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SOBPA7XYQ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SOBPA7XYQ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SOBPA7XYQ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SOBPA7XYQ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SOBPA7XYQ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SOBPA7XYQ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SOBPA7XYQ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SOBPA7XYQ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SOBPA7XYQ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SOBPA7XYQ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SOBPA7XYQ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SOBPA7XYQ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SOBPA7XYQ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SOBPA7XYQ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SOBPA7XYQ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
SOBPA7XYQ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SOBPA7XYQ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SOBPA7XYQ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SOBPA7XYQ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SOBPA7XYQ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SOBPA7XYQ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SOBPA7XYQ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SOBPA7XYQ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SOBPA7XYQ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SOBPA7XYQ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SOBPA7XYQ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOBPA7XYQ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SOBPA7XYQ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOBPA7XYQ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOBPA7XYQ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SOBPA7XYQ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SOBPA7XYQ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SOBPA7XYQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOBPA7XYQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOBPA7XYQ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SOBPA7XYQ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SOBPA7XYQ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOBPA7XYQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOBPA7XYQ1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
SOBPA7XYQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SOBPA7XYQ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SOBPA7XYQ1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SOBPA7XYQ1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SOBPA7XYQ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SOBPA7XYQ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SOBPA7XYQ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SOBPA7XYQ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SOBPA7XYQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SOBPA7XYQ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SOBPA7XYQ1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SOBPA7XYQ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SOBPA7XYQ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SOBPA7XYQ1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SOBPA7XYQ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
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