Protein–RNA interactions for Protein: A6NNX1

RIIAD1, RIIa domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIIAD1A6NNX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIIAD1A6NNX1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RIIAD1A6NNX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIIAD1A6NNX1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIIAD1A6NNX1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIIAD1A6NNX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RIIAD1A6NNX1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RIIAD1A6NNX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms