Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CBY3A6NI87 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CBY3A6NI87 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CBY3A6NI87 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CBY3A6NI87 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CBY3A6NI87 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CBY3A6NI87 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CBY3A6NI87 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBY3A6NI87 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CBY3A6NI87 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBY3A6NI87 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CBY3A6NI87 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CBY3A6NI87 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBY3A6NI87 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CBY3A6NI87 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBY3A6NI87 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBY3A6NI87 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CBY3A6NI87 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms