Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMX3A6NHT5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMX3A6NHT5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMX3A6NHT5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMX3A6NHT5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMX3A6NHT5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HMX3A6NHT5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMX3A6NHT5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMX3A6NHT5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms