Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C5orf51A6NDU8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C5orf51A6NDU8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C5orf51A6NDU8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C5orf51A6NDU8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C5orf51A6NDU8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C5orf51A6NDU8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms