Protein–RNA interactions for Protein: A4D174

C7orf71, Putative uncharacterized protein C7orf71, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf71A4D174 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C7orf71A4D174 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C7orf71A4D174 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
C7orf71A4D174 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C7orf71A4D174 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C7orf71A4D174 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms