Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM223A0PJW6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TMEM223A0PJW6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM223A0PJW6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM223A0PJW6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TMEM223A0PJW6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM223A0PJW6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms