Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TCRBV5S1A1TA0A578 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCRBV5S1A1TA0A578 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCRBV5S1A1TA0A578 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCRBV5S1A1TA0A578 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCRBV5S1A1TA0A578 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCRBV5S1A1TA0A578 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCRBV5S1A1TA0A578 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCRBV5S1A1TA0A578 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TCRBV5S1A1TA0A578 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCRBV5S1A1TA0A578 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCRBV5S1A1TA0A578 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCRBV5S1A1TA0A578 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCRBV5S1A1TA0A578 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCRBV5S1A1TA0A578 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms