Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVI7

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVI7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A1B0GVI7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A1B0GVI7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A1B0GVI7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A1B0GVI7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
A0A1B0GVI7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
A0A1B0GVI7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms