Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A0A1B0GTW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A0A1B0GTW7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
A0A1B0GTW7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
A0A1B0GTW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
A0A1B0GTW7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A1B0GTW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A1B0GTW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms