Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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