Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2A0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2A0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0B4J2A0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A0B4J2A0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0B4J2A0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0B4J2A0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
A0A0B4J2A0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
A0A0B4J2A0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0B4J2A0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0B4J2A0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
A0A0B4J2A0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0B4J2A0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0B4J2A0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
A0A0B4J2A0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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