Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NRXN3Q9Y4C0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NRXN3Q9Y4C0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
NRXN3Q9Y4C0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
NRXN3Q9Y4C0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NRXN3Q9Y4C0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NRXN3Q9Y4C0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NRXN3Q9Y4C0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NRXN3Q9Y4C0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NRXN3Q9Y4C0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NRXN3Q9Y4C0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NRXN3Q9Y4C0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NRXN3Q9Y4C0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NRXN3Q9Y4C0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NRXN3Q9Y4C0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NRXN3Q9Y4C0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NRXN3Q9Y4C0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NRXN3Q9Y4C0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NRXN3Q9Y4C0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
NRXN3Q9Y4C0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NRXN3Q9Y4C0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
NRXN3Q9Y4C0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
NRXN3Q9Y4C0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NRXN3Q9Y4C0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
NRXN3Q9Y4C0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
NRXN3Q9Y4C0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
NRXN3Q9Y4C0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
NRXN3Q9Y4C0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
NRXN3Q9Y4C0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
NRXN3Q9Y4C0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NRXN3Q9Y4C0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
NRXN3Q9Y4C0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NRXN3Q9Y4C0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NRXN3Q9Y4C0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
NRXN3Q9Y4C0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
NRXN3Q9Y4C0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
NRXN3Q9Y4C0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
NRXN3Q9Y4C0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
NRXN3Q9Y4C0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.71■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NRXN3Q9Y4C0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
NRXN3Q9Y4C0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
NRXN3Q9Y4C0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NRXN3Q9Y4C0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
NRXN3Q9Y4C0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms