Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC49.61■■■■■ 5.53
NRXN3Q9Y4C0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.19■■■■■ 5.46
NRXN3Q9Y4C0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.53■■■■■ 5.36
NRXN3Q9Y4C0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
NRXN3Q9Y4C0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.99■■■■■ 5.27
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.69■■■■■ 5.23
NRXN3Q9Y4C0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
NRXN3Q9Y4C0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC47.31■■■■■ 5.16
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
NRXN3Q9Y4C0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC46.91■■■■■ 5.1
NRXN3Q9Y4C0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.85■■■■■ 5.09
NRXN3Q9Y4C0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
NRXN3Q9Y4C0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
NRXN3Q9Y4C0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
NRXN3Q9Y4C0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.32■■■■■ 5.01
NRXN3Q9Y4C0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
NRXN3Q9Y4C0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
NRXN3Q9Y4C0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
NRXN3Q9Y4C0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.16■■■■■ 4.98
NRXN3Q9Y4C0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
NRXN3Q9Y4C0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
NRXN3Q9Y4C0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
NRXN3Q9Y4C0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.54■■■■■ 4.88
NRXN3Q9Y4C0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.43■■■■■ 4.86
NRXN3Q9Y4C0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
NRXN3Q9Y4C0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
NRXN3Q9Y4C0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.37■■■■■ 4.85
NRXN3Q9Y4C0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
NRXN3Q9Y4C0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
NRXN3Q9Y4C0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
NRXN3Q9Y4C0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
NRXN3Q9Y4C0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
NRXN3Q9Y4C0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC44.83■■■■■ 4.77
NRXN3Q9Y4C0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
NRXN3Q9Y4C0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
NRXN3Q9Y4C0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
NRXN3Q9Y4C0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
NRXN3Q9Y4C0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
NRXN3Q9Y4C0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
NRXN3Q9Y4C0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NRXN3Q9Y4C0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
NRXN3Q9Y4C0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
NRXN3Q9Y4C0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
NRXN3Q9Y4C0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
NRXN3Q9Y4C0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
NRXN3Q9Y4C0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NRXN3Q9Y4C0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.5■■■■■ 4.55
NRXN3Q9Y4C0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
NRXN3Q9Y4C0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
NRXN3Q9Y4C0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
NRXN3Q9Y4C0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
NRXN3Q9Y4C0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
NRXN3Q9Y4C0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
NRXN3Q9Y4C0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
NRXN3Q9Y4C0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
NRXN3Q9Y4C0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
NRXN3Q9Y4C0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
NRXN3Q9Y4C0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
NRXN3Q9Y4C0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NRXN3Q9Y4C0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
NRXN3Q9Y4C0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
NRXN3Q9Y4C0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
NRXN3Q9Y4C0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NRXN3Q9Y4C0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
NRXN3Q9Y4C0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NRXN3Q9Y4C0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.91■■■■■ 4.46
NRXN3Q9Y4C0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NRXN3Q9Y4C0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
NRXN3Q9Y4C0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NRXN3Q9Y4C0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NRXN3Q9Y4C0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NRXN3Q9Y4C0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NRXN3Q9Y4C0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NRXN3Q9Y4C0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
NRXN3Q9Y4C0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NRXN3Q9Y4C0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NRXN3Q9Y4C0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
NRXN3Q9Y4C0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
NRXN3Q9Y4C0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
NRXN3Q9Y4C0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
NRXN3Q9Y4C0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.55■■■■■ 4.4
NRXN3Q9Y4C0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NRXN3Q9Y4C0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NRXN3Q9Y4C0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
NRXN3Q9Y4C0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NRXN3Q9Y4C0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
NRXN3Q9Y4C0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
NRXN3Q9Y4C0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.36
NRXN3Q9Y4C0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
NRXN3Q9Y4C0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
NRXN3Q9Y4C0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NRXN3Q9Y4C0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NRXN3Q9Y4C0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.28■■■■■ 4.36
NRXN3Q9Y4C0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
NRXN3Q9Y4C0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
NRXN3Q9Y4C0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms