Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R0

COA3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA3Q9Y2R0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COA3Q9Y2R0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COA3Q9Y2R0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COA3Q9Y2R0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COA3Q9Y2R0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COA3Q9Y2R0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COA3Q9Y2R0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COA3Q9Y2R0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COA3Q9Y2R0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COA3Q9Y2R0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COA3Q9Y2R0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COA3Q9Y2R0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COA3Q9Y2R0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COA3Q9Y2R0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COA3Q9Y2R0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COA3Q9Y2R0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COA3Q9Y2R0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COA3Q9Y2R0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COA3Q9Y2R0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
COA3Q9Y2R0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
COA3Q9Y2R0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms