Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NINLQ9Y2I6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
NINLQ9Y2I6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NINLQ9Y2I6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NINLQ9Y2I6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
NINLQ9Y2I6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NINLQ9Y2I6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NINLQ9Y2I6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NINLQ9Y2I6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NINLQ9Y2I6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
NINLQ9Y2I6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NINLQ9Y2I6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
NINLQ9Y2I6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
NINLQ9Y2I6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NINLQ9Y2I6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NINLQ9Y2I6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NINLQ9Y2I6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NINLQ9Y2I6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NINLQ9Y2I6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
NINLQ9Y2I6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms