Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.57■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FNDC3AQ9Y2H6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FNDC3AQ9Y2H6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FNDC3AQ9Y2H6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FNDC3AQ9Y2H6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FNDC3AQ9Y2H6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FNDC3AQ9Y2H6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FNDC3AQ9Y2H6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FNDC3AQ9Y2H6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms