Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SORCS3Q9UPU3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SORCS3Q9UPU3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SORCS3Q9UPU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SORCS3Q9UPU3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SORCS3Q9UPU3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SORCS3Q9UPU3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SORCS3Q9UPU3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SORCS3Q9UPU3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SORCS3Q9UPU3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SORCS3Q9UPU3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SORCS3Q9UPU3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SORCS3Q9UPU3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SORCS3Q9UPU3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SORCS3Q9UPU3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SORCS3Q9UPU3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SORCS3Q9UPU3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SORCS3Q9UPU3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SORCS3Q9UPU3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms