Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PPT2Q9UMR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PPT2Q9UMR5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PPT2Q9UMR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPT2Q9UMR5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PPT2Q9UMR5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PPT2Q9UMR5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PPT2Q9UMR5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PPT2Q9UMR5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PPT2Q9UMR5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PPT2Q9UMR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPT2Q9UMR5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPT2Q9UMR5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PPT2Q9UMR5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PPT2Q9UMR5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms