Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSR3Q9UJK0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSR3Q9UJK0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR3Q9UJK0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSR3Q9UJK0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSR3Q9UJK0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSR3Q9UJK0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSR3Q9UJK0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSR3Q9UJK0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TSR3Q9UJK0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TSR3Q9UJK0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TSR3Q9UJK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TSR3Q9UJK0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TSR3Q9UJK0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSR3Q9UJK0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSR3Q9UJK0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSR3Q9UJK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms