Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW9

SLC12A6, Solute carrier family 12 member 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A6Q9UHW9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SLC12A6Q9UHW9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC12A6Q9UHW9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC12A6Q9UHW9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC12A6Q9UHW9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC12A6Q9UHW9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SLC12A6Q9UHW9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SLC12A6Q9UHW9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC12A6Q9UHW9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms