Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP2Q9UDT6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP2Q9UDT6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP2Q9UDT6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP2Q9UDT6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP2Q9UDT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CLIP2Q9UDT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLIP2Q9UDT6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CLIP2Q9UDT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLIP2Q9UDT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLIP2Q9UDT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CLIP2Q9UDT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CLIP2Q9UDT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CLIP2Q9UDT6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms