Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPASTQ9UBP0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPASTQ9UBP0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPASTQ9UBP0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SPASTQ9UBP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPASTQ9UBP0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPASTQ9UBP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPASTQ9UBP0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPASTQ9UBP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.6 ms