Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SLAIN2Q9P270 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
SLAIN2Q9P270 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SLAIN2Q9P270 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SLAIN2Q9P270 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SLAIN2Q9P270 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SLAIN2Q9P270 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SLAIN2Q9P270 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SLAIN2Q9P270 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SLAIN2Q9P270 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SLAIN2Q9P270 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
SLAIN2Q9P270 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SLAIN2Q9P270 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SLAIN2Q9P270 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SLAIN2Q9P270 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SLAIN2Q9P270 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
SLAIN2Q9P270 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
SLAIN2Q9P270 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
SLAIN2Q9P270 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.5■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.45■■■■□ 3.75
SLAIN2Q9P270 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SLAIN2Q9P270 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
SLAIN2Q9P270 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
SLAIN2Q9P270 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
SLAIN2Q9P270 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
SLAIN2Q9P270 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SLAIN2Q9P270 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SLAIN2Q9P270 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SLAIN2Q9P270 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SLAIN2Q9P270 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SLAIN2Q9P270 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SLAIN2Q9P270 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SLAIN2Q9P270 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SLAIN2Q9P270 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SLAIN2Q9P270 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SLAIN2Q9P270 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SLAIN2Q9P270 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SLAIN2Q9P270 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SLAIN2Q9P270 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SLAIN2Q9P270 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SLAIN2Q9P270 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
SLAIN2Q9P270 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SLAIN2Q9P270 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
SLAIN2Q9P270 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
SLAIN2Q9P270 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SLAIN2Q9P270 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SLAIN2Q9P270 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms