Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX43Q9NXZ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX43Q9NXZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX43Q9NXZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX43Q9NXZ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX43Q9NXZ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX43Q9NXZ2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX43Q9NXZ2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX43Q9NXZ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX43Q9NXZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX43Q9NXZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX43Q9NXZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDX43Q9NXZ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX43Q9NXZ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms