Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MS4A12Q9NXJ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MS4A12Q9NXJ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A12Q9NXJ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A12Q9NXJ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MS4A12Q9NXJ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MS4A12Q9NXJ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A12Q9NXJ0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A12Q9NXJ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A12Q9NXJ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms