Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HPF1Q9NWY4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HPF1Q9NWY4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HPF1Q9NWY4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HPF1Q9NWY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPF1Q9NWY4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPF1Q9NWY4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HPF1Q9NWY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPF1Q9NWY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPF1Q9NWY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPF1Q9NWY4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HPF1Q9NWY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HPF1Q9NWY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HPF1Q9NWY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms