Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA4GQ9NTN9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SEMA4GQ9NTN9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA4GQ9NTN9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA4GQ9NTN9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4GQ9NTN9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SEMA4GQ9NTN9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4GQ9NTN9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA4GQ9NTN9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA4GQ9NTN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA4GQ9NTN9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA4GQ9NTN9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA4GQ9NTN9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA4GQ9NTN9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA4GQ9NTN9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA4GQ9NTN9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA4GQ9NTN9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEMA4GQ9NTN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA4GQ9NTN9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA4GQ9NTN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA4GQ9NTN9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEMA4GQ9NTN9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA4GQ9NTN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA4GQ9NTN9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA4GQ9NTN9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA4GQ9NTN9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4GQ9NTN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms