Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SEMA4GQ9NTN9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SEMA4GQ9NTN9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SEMA4GQ9NTN9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SEMA4GQ9NTN9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SEMA4GQ9NTN9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SEMA4GQ9NTN9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEMA4GQ9NTN9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SEMA4GQ9NTN9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
SEMA4GQ9NTN9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SEMA4GQ9NTN9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SEMA4GQ9NTN9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
SEMA4GQ9NTN9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SEMA4GQ9NTN9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SEMA4GQ9NTN9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SEMA4GQ9NTN9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SEMA4GQ9NTN9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SEMA4GQ9NTN9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SEMA4GQ9NTN9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
SEMA4GQ9NTN9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEMA4GQ9NTN9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SEMA4GQ9NTN9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEMA4GQ9NTN9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SEMA4GQ9NTN9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SEMA4GQ9NTN9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEMA4GQ9NTN9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
SEMA4GQ9NTN9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SEMA4GQ9NTN9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
SEMA4GQ9NTN9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SEMA4GQ9NTN9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SEMA4GQ9NTN9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SEMA4GQ9NTN9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEMA4GQ9NTN9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SEMA4GQ9NTN9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SEMA4GQ9NTN9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SEMA4GQ9NTN9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SEMA4GQ9NTN9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SEMA4GQ9NTN9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SEMA4GQ9NTN9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SEMA4GQ9NTN9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SEMA4GQ9NTN9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SEMA4GQ9NTN9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEMA4GQ9NTN9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEMA4GQ9NTN9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SEMA4GQ9NTN9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SEMA4GQ9NTN9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SEMA4GQ9NTN9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SEMA4GQ9NTN9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SEMA4GQ9NTN9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SEMA4GQ9NTN9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SEMA4GQ9NTN9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SEMA4GQ9NTN9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEMA4GQ9NTN9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SEMA4GQ9NTN9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SEMA4GQ9NTN9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEMA4GQ9NTN9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SEMA4GQ9NTN9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA4GQ9NTN9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SEMA4GQ9NTN9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SEMA4GQ9NTN9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SEMA4GQ9NTN9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SEMA4GQ9NTN9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA4GQ9NTN9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SEMA4GQ9NTN9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SEMA4GQ9NTN9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SEMA4GQ9NTN9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SEMA4GQ9NTN9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SEMA4GQ9NTN9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEMA4GQ9NTN9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEMA4GQ9NTN9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SEMA4GQ9NTN9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEMA4GQ9NTN9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEMA4GQ9NTN9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SEMA4GQ9NTN9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SEMA4GQ9NTN9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SEMA4GQ9NTN9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA4GQ9NTN9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA4GQ9NTN9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SEMA4GQ9NTN9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SEMA4GQ9NTN9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA4GQ9NTN9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SEMA4GQ9NTN9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SEMA4GQ9NTN9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA4GQ9NTN9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SEMA4GQ9NTN9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA4GQ9NTN9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA4GQ9NTN9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SEMA4GQ9NTN9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA4GQ9NTN9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA4GQ9NTN9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SEMA4GQ9NTN9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SEMA4GQ9NTN9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SEMA4GQ9NTN9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SEMA4GQ9NTN9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SEMA4GQ9NTN9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SEMA4GQ9NTN9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SEMA4GQ9NTN9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA4GQ9NTN9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA4GQ9NTN9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SEMA4GQ9NTN9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms