Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG7

SIRT3, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT3Q9NTG7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT3Q9NTG7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT3Q9NTG7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT3Q9NTG7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT3Q9NTG7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIRT3Q9NTG7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIRT3Q9NTG7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT3Q9NTG7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT3Q9NTG7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT3Q9NTG7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIRT3Q9NTG7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIRT3Q9NTG7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT3Q9NTG7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIRT3Q9NTG7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIRT3Q9NTG7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIRT3Q9NTG7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT3Q9NTG7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT3Q9NTG7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIRT3Q9NTG7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT3Q9NTG7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIRT3Q9NTG7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIRT3Q9NTG7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT3Q9NTG7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIRT3Q9NTG7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT3Q9NTG7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT3Q9NTG7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT3Q9NTG7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT3Q9NTG7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT3Q9NTG7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT3Q9NTG7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SIRT3Q9NTG7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT3Q9NTG7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SIRT3Q9NTG7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms