Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNTG1Q9NSN8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNTG1Q9NSN8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNTG1Q9NSN8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNTG1Q9NSN8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNTG1Q9NSN8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNTG1Q9NSN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNTG1Q9NSN8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNTG1Q9NSN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms